国内刊号:22-1108/R
国际刊号:1001-5256
发布日期:
作者:肖春阳, 李沁恺, 于景霞, 刘婷, 陆伦根, 徐铭益
单位:上海交通大学附属第一人民医院消化科
关键词:肝炎,乙型,慢性, 肝硬化, 基因表达, 微阵列分析
基金: 基金项目: 国家科技部“十二五”重大专项(2013ZX10002004-002-003); 国家自然基金面上项目(81570547); 院优秀青年培养计划(061405); 目的采用基因芯片技术筛选预测乙型肝炎肝硬化发生的风险基因。方法收集2008年4月-2010年12月于上海交通大学附属第一人民医院就诊的慢性乙型肝炎(CHB)患者40例,建立蕊片筛选风险基因队列(分为5组:S0、S1、S2、S3、S4;每组8例),肝活组织病理学检查确定肝纤维化分期(以Scheuer病理评分为标准),另留取临床资料和肝组织样本。采用人Affymetrix基因芯片技术检测CHB患者肝组织的基因表达谱,微阵列显著分析(SAM)和微阵列预测分析(PAM)筛选预测肝硬化发生的风险基因组。实时定量PCR验证风险基因mRNA在肝组织中的表达情况。分类资料采用χ2检验进行比较;符合正态分布的连续变量比较采用t检验和单因素方差分析,进一步两两比较采用SNK-q检验;不满足正态分布的采用Mann-Whitney U秩和检验。结果Affymetrix基因芯片共筛选出1674个差异表达基因,差异基因聚类分析显示肝纤维化分期不同,组间的基因表达也存在差异,从而提示基因表达谱与组织纤维化分期存在较好的一致性。以4种不同的分类法分析,SAM筛选出87个显著基因,进而采用PAM筛选出14个"高风险"基... 来源:2016年第7期 《临床肝胆病》期刊编辑部 查看临床肝胆病杂志2016年第7期
国家科技部“十二五”重大专项(2013ZX10002004-002-003); 国家自然基金面上项目(81570547); 院优秀青年培养计划(061405);
目的采用基因芯片技术筛选预测乙型肝炎肝硬化发生的风险基因。方法收集2008年4月-2010年12月于上海交通大学附属第一人民医院就诊的慢性乙型肝炎(CHB)患者40例,建立蕊片筛选风险基因队列(分为5组:S0、S1、S2、S3、S4;每组8例),肝活组织病理学检查确定肝纤维化分期(以Scheuer病理评分为标准),另留取临床资料和肝组织样本。采用人Affymetrix基因芯片技术检测CHB患者肝组织的基因表达谱,微阵列显著分析(SAM)和微阵列预测分析(PAM)筛选预测肝硬化发生的风险基因组。实时定量PCR验证风险基因mRNA在肝组织中的表达情况。分类资料采用χ2检验进行比较;符合正态分布的连续变量比较采用t检验和单因素方差分析,进一步两两比较采用SNK-q检验;不满足正态分布的采用Mann-Whitney U秩和检验。结果Affymetrix基因芯片共筛选出1674个差异表达基因,差异基因聚类分析显示肝纤维化分期不同,组间的基因表达也存在差异,从而提示基因表达谱与组织纤维化分期存在较好的一致性。以4种不同的分类法分析,SAM筛选出87个显著基因,进而采用PAM筛选出14个"高风险"基...
来源:2016年第7期
《临床肝胆病》期刊编辑部
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