临床肝胆病杂志

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),WJCI

国内刊号:22-1108/R

国际刊号:1001-5256

临床肝胆病杂志2018年第1期:肝硬化合并门静脉血栓患者的差异蛋白筛选

发布日期:

作者:熊静平, 彭媛媛, 张跃新

单位:1.新疆医科大学第一附属医院感染疾病中心2.新疆医科大学第二附属医院消化科

关键词:肝硬化, 静脉血栓形成, 蛋白质组学

基金:

目的筛选肝硬化合并门静脉血栓形成(PVT)患者的血清差异表达蛋白。方法收集2015年11月-2016年11月在新疆医科大学第一附属医院感染疾病中心住院的45例肝硬化患者血清标本,其中合并PVT患者22例,无PVT患者23例。采用相对和绝对同位素定量标记(i TRAQ)联合色谱质谱技术筛选两组患者的血清差异蛋白,并对差异蛋白进行生物信息学分析。非正态分布的计量资料组间比较采用Mann-Whitney U检验;计数资料组间比较采用χ2检验。采用Fisher确切检验比较各个GO分类或KEGG通路在目标蛋白质集合和总体蛋白质集合中的分布情况,以此评价某个GO term或KEGG通路蛋白质富集度的显著性水平。结果共筛选出800个蛋白。有差异的蛋白86个,其中32个蛋白上调(ratio≥1.2,P<0.05),54个蛋白下调(ratio≤0.83,P<0.05)。在这些蛋白中,有14类蛋白与细胞组分有关,22类蛋白与生化过程有关,10类蛋白与分子功能有关。使用KEGG分析发现肝硬化合并PVT组较无PVT组有18个蛋白在5个代谢和信号通路中有显著的差异。5个代谢和信...

来源:2018年第1期

《临床肝胆病》期刊编辑部

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