国内刊号：22-1108/R
国际刊号：1001-5256
发布日期:
作者：张玉鹏, 王帆, 陈鹏飞, 刘适, 刘岚, 常莹, 赵秋
单位：1.武汉市武汉大学中南医院消化内科2.湖北省肠病医学临床研究中心3.肠病湖北省重点实验室
关键词：癌,肝细胞, 4-氨基丁酸转氨酶, 数据库,遗传学, 基因
基金： 基金项目: 国家自然科学基金项目(81670554)； 目的利用数据库分析基因ABAT在肝细胞癌中的表达以及意义。方法利用Oncomine数据库及GEPIA分析ABAT在肝细胞癌组织中的表达情况;利用GEPIA做ABAT mRNA与肝细胞癌患者生存期以及与病理分期程度的相关性分析;经MethHC数据库分析ABAT基因启动子区甲基化水平; String数据库分析与ABAT蛋白相互作用的蛋白网络;通过The Human Protein Atlas分析ABAT蛋白在肝细胞癌组织中的表达情况以及ABAT在蛋白水平上对患者预后的影响。结果 mRNA水平上,ABAT在肝细胞癌组织中较正常肝组织显著低表达,其mRNA水平低者预后较差（log-rank,P=0. 002 1）,ABAT mRNA水平越低者病理分期恶性程度越高（P=0. 002 34）。ABAT蛋白在肝细胞癌组织中也较正常肝组织表达降低,蛋白表达水平低的患者预后较差（log-rank,P=2. 14×10-3）。肝细胞癌中ABAT基因启动子区甲基化水平较正常肝组织显著升高（P <0. 005）。与ABAT相互作用的蛋白有ALDH1A3、ALDH9A1、ALDH3A2、GAD1、GAD2... 来源：2019年第3期 《临床肝胆病》期刊编辑部 查看临床肝胆病杂志2019年第3期
国家自然科学基金项目(81670554)；
目的利用数据库分析基因ABAT在肝细胞癌中的表达以及意义。方法利用Oncomine数据库及GEPIA分析ABAT在肝细胞癌组织中的表达情况;利用GEPIA做ABAT mRNA与肝细胞癌患者生存期以及与病理分期程度的相关性分析;经MethHC数据库分析ABAT基因启动子区甲基化水平; String数据库分析与ABAT蛋白相互作用的蛋白网络;通过The Human Protein Atlas分析ABAT蛋白在肝细胞癌组织中的表达情况以及ABAT在蛋白水平上对患者预后的影响。结果 mRNA水平上,ABAT在肝细胞癌组织中较正常肝组织显著低表达,其mRNA水平低者预后较差（log-rank,P=0. 002 1）,ABAT mRNA水平越低者病理分期恶性程度越高（P=0. 002 34）。ABAT蛋白在肝细胞癌组织中也较正常肝组织表达降低,蛋白表达水平低的患者预后较差（log-rank,P=2. 14×10-3）。肝细胞癌中ABAT基因启动子区甲基化水平较正常肝组织显著升高（P <0. 005）。与ABAT相互作用的蛋白有ALDH1A3、ALDH9A1、ALDH3A2、GAD1、GAD2...
来源：2019年第3期
《临床肝胆病》期刊编辑部
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