临床肝胆病杂志

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),WJCI

国内刊号:22-1108/R

国际刊号:1001-5256

临床肝胆病杂志2019年第3期:酒精性肝炎microRNA-mRNA差异表达网络的生物信息学分析

发布日期:

作者:张秀芝, 李宁宁, 刘晓丽, 亢春彦, 张进忠

单位:1.河南医学高等专科学校病理教研室2.河南省人民医院检验科

关键词:肝炎,酒精性, 微RNA, RNA,信使, 基因调控网络, 信号传导, 基因疗法

基金:

基金项目: 

河南省科技攻关计划项目(142102310441); 

目的构建酒精性肝炎(AH)的microRNA-mRNA差异表达网络,寻找AH新的诊疗靶标。方法筛选AH差异表达的microRNA和mRNA;基于TargetScan、DIANA、MIRDB、PICTAR、miRWalk2. 0等软件寻找差异microRNA靶基因,选取差异mRNA中与microRNA变化方向相反的靶基因,构建关键microRNA-mRNA网络;通过注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)对相关靶基因进行基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路分析;通过GCBI (www. gcbi. com. cn)在线软件对靶基因进行疾病富集分析和核心网络构建;通过Cytoscape软件中GeneMANIA数据库(genemania. org)对关键靶基因进行蛋白相互作用分析,对比3种方法通路分析寻找AH发生过程中的关键通路。结果构建以hsa-mir-21-5p、hsa-mir-148a-3p和hsa-mir-30e-5p等5个差异microRNA及Ⅳ胶原α1链(COL4A1)、血栓反应素2(THBS2)和整合素亚单位α6(ITGA6)等51个靶基因为...

来源:2019年第3期

《临床肝胆病》期刊编辑部

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