临床肝胆病杂志

基金项目: 

国家自然科学基金(81603612)； 陕西省科技厅科研基金(2016SF-234,2018KJXX-093)； 宁夏回族自治区自然科学基金(NZ17278)； 

目的本研究基于肝癌相关非编码RNA高通量测序数据,构建互作网络及功能富集分析,筛选可能通过竞争性内源RNA（ceRNA）机制参与肝癌发生发展的环状RNA（circRNA）。方法利用GEO数据库中的肝癌非编码RNA高通量测序数据,依据ceRNA理论构建circRNA-miRNA-mRNA网络。随后,进行了基因本体论分析（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析,用于具有ceRNA潜在功能的circRNA的探索及功能注释。结果从GEO数据库中最终筛选了9个共表达circRNAs、20个共表达miRNAs以及153个共表达mRNAs,成功构建肝癌相关circRNA-miRNA-mRNA网络。GO分析结果揭示了90个生物过程,其主要涉及12个功能簇,主要包括肝细胞分化、细胞周期相变调节、转录因子活性负调控等功能,KEGG分析表明这些共表达circRNAs还参与p53、PI3K-Akt信号通路。结论本研究为circRNA通过ceRNA机制介导肝癌发生发展提供了新的见解。

来源：2019年第8期

《临床肝胆病》期刊编辑部

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