国内刊号:22-1108/R
国际刊号:1001-5256
发布日期:
作者:向晓辉, 毛骏, 李海
单位:1.天津市西青医院消化内科2.天津市肝脏胰腺纤维化与分子诊疗重点实验室3.武警后勤学院
关键词:癌,肝细胞, 卷曲螺旋结构域蛋白34, 基因表达, 计算生物学
基金: 基金项目: 天津市自然科学基金项目(17JCYBJC26700); 目的研究卷曲螺旋结构域蛋白34(CCDC34)基因在肝细胞癌中的表达以及临床价值,预测CCDC34基因在肝细胞癌发生发展中的作用。方法从癌症基因组图谱(TCGA)下载肝细胞癌数据集,获得CCDC34基因表达谱和临床信息。利用生物信息学方法,分析CCDC34基因在肝细胞癌中的表达水平与临床病理指标的相关性以及对预后的影响。用基因集富集分析(GSEA)预测CCDC34基因在肝细胞癌中调控的可能通路。计量资料2组间比较分别采用独立样本t检验及配对t检验。生存分析采用Kaplan-Meier法及log-rank检验;并运用Cox比例风险回归模型分析影响患者预后的危险因素。GSEA判断显著性富集的标准为P<0. 01,且错误发现率(FDR)<0. 05。结果在TCGA数据库中,CCDC34基因在肿瘤组织中高表达,其表达水平在TNM分期和肿瘤分级之间差异均有统计学意义(t值分别为2.118、3.622,P值分别为0. 035、<0. 001)。CCDC34基因高表达的患者总生存期明显低于CCDC34基因低表达的患者(χ2=21.716,P<0. 05)... 来源:2020年第5期 《临床肝胆病》期刊编辑部 查看临床肝胆病杂志2020年第5期
天津市自然科学基金项目(17JCYBJC26700);
目的研究卷曲螺旋结构域蛋白34(CCDC34)基因在肝细胞癌中的表达以及临床价值,预测CCDC34基因在肝细胞癌发生发展中的作用。方法从癌症基因组图谱(TCGA)下载肝细胞癌数据集,获得CCDC34基因表达谱和临床信息。利用生物信息学方法,分析CCDC34基因在肝细胞癌中的表达水平与临床病理指标的相关性以及对预后的影响。用基因集富集分析(GSEA)预测CCDC34基因在肝细胞癌中调控的可能通路。计量资料2组间比较分别采用独立样本t检验及配对t检验。生存分析采用Kaplan-Meier法及log-rank检验;并运用Cox比例风险回归模型分析影响患者预后的危险因素。GSEA判断显著性富集的标准为P<0. 01,且错误发现率(FDR)<0. 05。结果在TCGA数据库中,CCDC34基因在肿瘤组织中高表达,其表达水平在TNM分期和肿瘤分级之间差异均有统计学意义(t值分别为2.118、3.622,P值分别为0. 035、<0. 001)。CCDC34基因高表达的患者总生存期明显低于CCDC34基因低表达的患者(χ2=21.716,P<0. 05)...
来源:2020年第5期
《临床肝胆病》期刊编辑部
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