国内刊号:22-1108/R
国际刊号:1001-5256
发布日期:
作者:李菁, 莫嘉浩, 许洪彬, 朱俊霞, 史佩玉, 邢万里, 钟崇, 林丽珠
单位:1.广州中医药大学第一临床医学院2.湖南中医药大学第一附属医院肿瘤科3.广州中医药大学第二临床医学院4.广州中医药大学第一附属医院
关键词:四逆散, 肝肿瘤, 分子对接模拟, 网络药理学
基金: 基金项目: 国家自然科学基金(81873303); 湖南省自然基金青年项目(2016JJ6113); 湖南中医药大学中医学一流学科开放基金项目(2018ZYX51); 湖南省卫健委科研计划项目(20200949); 广东省中医药管理局名中医传承工作室建设项目(粤中医办函2018[5]号); 目的联合网络药理学-分子对接研究四逆散治疗肝癌的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取四逆散的化合物及靶标,通过Uniprot获取对应的基因Symbol;从人类基因数据库获取肝癌的疾病基因,并筛选出与四逆散靶标基因的交集基因;运用Cytoscape3.7.1软件绘制"中药-化合物-治疗靶标"网络图;运用STRING构建蛋白质相互作用(PPI)网络、R studio软件对治疗靶标进行GO和KEGG富集分析,并对结果进行可视化;选择靶点数目最多的活性成分作为配体,PPI网络中度值(Degree)最大的靶点作为受体,预测受体-配体复合物结构与相互结合的氨基酸残基。结果研究筛选得到四逆散治疗肝癌核心靶标91个,相关活性成分141种,其中槲皮素、山柰酚等为四逆散治疗肝癌的主要活性成分; TP53、HSP90AA1等是治疗主要作用靶标; GO富集分析后共获得符合筛选标准的条目1007条,主要涉及抗氧化反应、蛋白丝氨酸-苏氨酸激酶活性调控、细胞应激反应等多个生物过程,KEGG富集分析共获得102条,主要调控乙型肝炎通路、PI3K-Akt信号通路以防治肝癌,分子对接结果验证... 来源:2020年第9期 《临床肝胆病》期刊编辑部 查看临床肝胆病杂志2020年第9期
国家自然科学基金(81873303); 湖南省自然基金青年项目(2016JJ6113); 湖南中医药大学中医学一流学科开放基金项目(2018ZYX51); 湖南省卫健委科研计划项目(20200949); 广东省中医药管理局名中医传承工作室建设项目(粤中医办函2018[5]号);
目的联合网络药理学-分子对接研究四逆散治疗肝癌的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取四逆散的化合物及靶标,通过Uniprot获取对应的基因Symbol;从人类基因数据库获取肝癌的疾病基因,并筛选出与四逆散靶标基因的交集基因;运用Cytoscape3.7.1软件绘制"中药-化合物-治疗靶标"网络图;运用STRING构建蛋白质相互作用(PPI)网络、R studio软件对治疗靶标进行GO和KEGG富集分析,并对结果进行可视化;选择靶点数目最多的活性成分作为配体,PPI网络中度值(Degree)最大的靶点作为受体,预测受体-配体复合物结构与相互结合的氨基酸残基。结果研究筛选得到四逆散治疗肝癌核心靶标91个,相关活性成分141种,其中槲皮素、山柰酚等为四逆散治疗肝癌的主要活性成分; TP53、HSP90AA1等是治疗主要作用靶标; GO富集分析后共获得符合筛选标准的条目1007条,主要涉及抗氧化反应、蛋白丝氨酸-苏氨酸激酶活性调控、细胞应激反应等多个生物过程,KEGG富集分析共获得102条,主要调控乙型肝炎通路、PI3K-Akt信号通路以防治肝癌,分子对接结果验证...
来源:2020年第9期
《临床肝胆病》期刊编辑部
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