国内刊号:22-1108/R
国际刊号:1001-5256
发布日期:
作者:王志鑫, 苟平, 于文昊, 任利, 阳丹才让, 王海久, 樊海宁
单位:1.青海大学附属医院肝胆胰外科2.青海省包虫病重点实验室
关键词:棘球蚴病,肝, 胆汁, 外泌体, 微RNAs, 计算生物学
基金: 基金项目: 青海省科技厅重大科技专项(2016-SF-A5); 第二批青海省“高端创新人才千人计划”(培养拔尖人才)项目; 青海大学中青年科研基金项目(2016-QYY-4);青海大学附属医院中青年科研基金重点项目(ASRF-2016-01); 目的检测肝泡型包虫病侵及胆道患者胆汁中外泌体microRNA(miRNA)的表达情况,探索差异miRNA对靶基因的调控机制。方法收集自2017年8月-2018年10月就诊于青海大学附属医院的12例肝泡型包虫病患者胆汁样本,观察组(有胆道受侵表现)与对照组(无胆道受侵表现)各6例。经超速离心法提取、Western Blot鉴定两组胆汁中的外泌体结构,采用Trizol法提取外泌体总RNA,再经miRNA表达谱芯片实验检测并寻找差异表达的miRNA。根据差异miRNA预测胆道侵犯靶基因,并进行通路富集分析。结果观察组与对照组比较,共有74个差异表达的miRNAs,其中9个表达上调,65个表达下调(|Fold Change|> 2)。经Pathway分析,靶基因主要富集在肿瘤发生、磷脂酰肌醇信号系统、PTEN等通路中(FDR <0.05)。经GO注释及富集分析,靶基因主要富集在基因抑制的正向调控、调控细胞分化等生物过程(FDR <0.05)。结论建立肝泡型包虫病合并胆道侵犯胆汁中外泌体差异miRNA表达谱,可作为泡型包虫病侵及胆道的生物学标志物,初步阐释了肝泡型包虫病侵及胆道... 来源:2020年第9期 《临床肝胆病》期刊编辑部 查看临床肝胆病杂志2020年第9期
青海省科技厅重大科技专项(2016-SF-A5); 第二批青海省“高端创新人才千人计划”(培养拔尖人才)项目; 青海大学中青年科研基金项目(2016-QYY-4);青海大学附属医院中青年科研基金重点项目(ASRF-2016-01);
目的检测肝泡型包虫病侵及胆道患者胆汁中外泌体microRNA(miRNA)的表达情况,探索差异miRNA对靶基因的调控机制。方法收集自2017年8月-2018年10月就诊于青海大学附属医院的12例肝泡型包虫病患者胆汁样本,观察组(有胆道受侵表现)与对照组(无胆道受侵表现)各6例。经超速离心法提取、Western Blot鉴定两组胆汁中的外泌体结构,采用Trizol法提取外泌体总RNA,再经miRNA表达谱芯片实验检测并寻找差异表达的miRNA。根据差异miRNA预测胆道侵犯靶基因,并进行通路富集分析。结果观察组与对照组比较,共有74个差异表达的miRNAs,其中9个表达上调,65个表达下调(|Fold Change|> 2)。经Pathway分析,靶基因主要富集在肿瘤发生、磷脂酰肌醇信号系统、PTEN等通路中(FDR <0.05)。经GO注释及富集分析,靶基因主要富集在基因抑制的正向调控、调控细胞分化等生物过程(FDR <0.05)。结论建立肝泡型包虫病合并胆道侵犯胆汁中外泌体差异miRNA表达谱,可作为泡型包虫病侵及胆道的生物学标志物,初步阐释了肝泡型包虫病侵及胆道...
来源:2020年第9期
《临床肝胆病》期刊编辑部
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