临床肝胆病杂志

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),WJCI

国内刊号:22-1108/R

国际刊号:1001-5256

临床肝胆病杂志2021年第4期:慢加急性肝衰竭不同预后患者血浆外泌体差异蛋白的生物信息学分析

发布日期:

作者:焦彦, 张莹, 时红林, 卢旺, 陈德喜, 陈煜, 时红波

单位:1.首都医科大学附属北京佑安医院,北京市肝病研究所,北京1000692.北京市肝炎与肝癌精准医疗及转化工程技术研究中心,北京1000693.首都医科大学附属北京佑安医院肝病中心四科,肝衰竭与人工肝治疗研究北京市重点实验室,北京100069

关键词:慢加急性肝功能衰竭, 外泌体, 蛋白质组学, 计算生物学

基金:

基金项目: 

北京市属医学科研院所公益发展改革试点项目 (京医研2019-6);

  目的  筛选不同预后慢加急性肝衰竭(ACLF)患者血浆外泌体中的差异蛋白, 分析其功能及生物学过程, 为患者临床诊断提供参考依据。  方法  前瞻性选取2019年7月—10月于首都医科大学附属北京佑安医院住院确诊的ACLF患者10例, 随访90 d, 患者死亡或肝移植归入肝移植/死亡组(n=5), 患者存活归入生存组(n=5), 两组一般资料指标比较采用Mann-Whitney U秩和检验。采用非标记(Label-free) 定量蛋白质组学技术对血浆外泌体蛋白进行鉴定和定量分析, 筛选差异蛋白并进行功能富集分析, 使用R-3.5.1软件对差异蛋白进行层次聚类分析, 分析其参与的生物学过程。  结果  外泌体蛋白质组学分析共鉴定出860种蛋白, 以倍数上调>1.2倍或下调>1.2倍且P<0.05的标准筛选出差异表达蛋白116种, 与肝移植/死亡组相比, 生存组上调蛋白62种、下调蛋白54种。生物信息学分析结果显示, 这些蛋白主要参与了免疫反应、信号转导、囊泡介导的转运、细胞死亡和增殖等生物学过程, 并与炎症反应、糖类和氨基酸代谢、肝细胞损伤及再生等信号通路密切相关。  结论  非标记定量蛋白质组学技术筛选出的差异蛋白可能作为ACLF早期诊断及预后判断的血清学标志物。

来源:2021年第4期

《临床肝胆病》期刊编辑部

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