国内刊号:22-1108/R
国际刊号:1001-5256
发布日期:
作者:郝健亨, 李振城, 刘莹, 侯艺文, 高艳, 苗宇船, 刘杨, 郝慧琴
单位:山西中医药大学基础医学院,山西晋中030619
关键词:肝炎, 自身免疫性, 微RNAs, 计算生物学
基金: 基金项目: 山西省教育厅科技创新项目 (2020L0423); 山西中 目的 探讨了刀豆蛋白A(ConA)诱导的自身免疫性肝炎(AIH)小鼠模型肝损伤发生发展过程中差异表达microRNA(miRNA)的变化和潜在作用。 方法 健康雄性SPF级C57BL/6小鼠8只,随机分为模型组(n=4)和对照组(n=4)。模型组按15 mg/kg的剂量给予尾静脉注射ConA,对照组给予等剂量生理盐水,造模8 h后处死全部小鼠,提取肝组织总RNA,采用基因芯片筛选差异表达miRNA,并对表达上调及表达下调的miRNA进行靶基因预测和功能分析。两组间比较采用独立样本t检验鉴定差异表达的miRNA。 结果 主成分分析结果显示,基因芯片中所提取数据的组间差异满足进一步分析的条件。与对照组比较,模型组小鼠肝脏中共检测到31个上调和18个下调表达的miRNA,与959个(601个上调,358个下调)靶基因存在调控关系。GO分析显示,与对照组比较,模型组中表达上调miRNA的靶基因主要具备"DNA binding"(P值=1.47×10-6)等分子功能,参与"transcription,DNA-templated"(P=2.36×10-7) 等生物学过程,并主要富集在"neuronal cell body"(P=5.99×10-6)等细胞组分。表达下调miRNA的靶基因主要具备"RNA polymerase Ⅱ proximal promoter sequence-specific DNA binding"(P=2.49×10-6)等分子功能,参与"regulation of transcription, DNA-templated"(P=1.64×10-11)等生物过程,并主要富集在"nucleoplasm"(P=4.30×10-10)等细胞组分。KEGG通路分析结果表明上调靶点主要涉及"Endocytosis"(P=0.000 4)等,下调靶点主要涉及"Hippo信号通路"(P=0.004)。 结论 AIH的发病中存在miRNA差异表达,这些miRNA差异表达谱可以为AIH的临床治疗提供新的靶点。 来源:2021年第6期 《临床肝胆病》期刊编辑部 查看临床肝胆病杂志2021年第6期
山西省教育厅科技创新项目 (2020L0423);
山西中
目的 探讨了刀豆蛋白A(ConA)诱导的自身免疫性肝炎(AIH)小鼠模型肝损伤发生发展过程中差异表达microRNA(miRNA)的变化和潜在作用。 方法 健康雄性SPF级C57BL/6小鼠8只,随机分为模型组(n=4)和对照组(n=4)。模型组按15 mg/kg的剂量给予尾静脉注射ConA,对照组给予等剂量生理盐水,造模8 h后处死全部小鼠,提取肝组织总RNA,采用基因芯片筛选差异表达miRNA,并对表达上调及表达下调的miRNA进行靶基因预测和功能分析。两组间比较采用独立样本t检验鉴定差异表达的miRNA。 结果 主成分分析结果显示,基因芯片中所提取数据的组间差异满足进一步分析的条件。与对照组比较,模型组小鼠肝脏中共检测到31个上调和18个下调表达的miRNA,与959个(601个上调,358个下调)靶基因存在调控关系。GO分析显示,与对照组比较,模型组中表达上调miRNA的靶基因主要具备"DNA binding"(P值=1.47×10-6)等分子功能,参与"transcription,DNA-templated"(P=2.36×10-7) 等生物学过程,并主要富集在"neuronal cell body"(P=5.99×10-6)等细胞组分。表达下调miRNA的靶基因主要具备"RNA polymerase Ⅱ proximal promoter sequence-specific DNA binding"(P=2.49×10-6)等分子功能,参与"regulation of transcription, DNA-templated"(P=1.64×10-11)等生物过程,并主要富集在"nucleoplasm"(P=4.30×10-10)等细胞组分。KEGG通路分析结果表明上调靶点主要涉及"Endocytosis"(P=0.000 4)等,下调靶点主要涉及"Hippo信号通路"(P=0.004)。 结论 AIH的发病中存在miRNA差异表达,这些miRNA差异表达谱可以为AIH的临床治疗提供新的靶点。
来源:2021年第6期
《临床肝胆病》期刊编辑部
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