临床肝胆病杂志

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),WJCI

国内刊号:22-1108/R

国际刊号:1001-5256

临床肝胆病杂志2021年第8期:转录组测序分析高尔基体蛋白73参与调控肝癌的作用机制

发布日期:

作者:叶佩灵, 嘉红云, 彭亮

单位:1.广州医科大学附属第二医院检验科,广州5102602.广州医科大学附属第五医院检验科,广州510700

关键词:肝肿瘤, 转录组, 信号传导

基金:

基金项目: 

广东省医学科学技术研究基金 (A2018153);

广州市

  目的  基于转录组分析技术, 探索高尔基体蛋白73(GP73)参与调控肝癌的作用机制。  方法  将肝癌细胞株Hep3B分为4组: GP73干扰组和对照组、GP73过表达组和对照组, 采用转录组测序技术检测4组样本mRNA的表达。根据测序数据筛选差异表达基因, 通过GO功能分析和KEGG富集分析差异表达基因。Western Blot实验验证信号通路相关蛋白的表达。符合正态分布的计量资料2组间比较采用t检验。  结果  通过分析Hep3B细胞干扰和过表达GP73后的差异表达基因, GO分析结果揭示了586个生物过程, GP73主要参与了细胞过程、单个组织的过程、生物调节等功能。KEGG分析表明GP73主要参与了PI3K-AKT、细胞因子/细胞因子受体相互作用、TNF、JAK-STAT等与肝癌密切相关的信号通路。Western Blot验证PI3K-AKT信号通路中的3个蛋白PI3K、p-AKT和AKT, 干扰组和过表达组的蛋白PI3K、p-AKT和对照组比较均有显著差异(P值均<0.05)。  结论  通过转录组测序和生物信息分析筛选到GP73主要参与调控肝癌的信号通路, 为阐明GP73对肝癌的作用机制提供了新的思路。

来源:2021年第8期

《临床肝胆病》期刊编辑部

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